12个HPC教程汇总!从入门到实战,覆盖分子模拟/材料计算/生物信息分析等多个领域
它通过并行处理、大规模计算资源的整合,极大提升了计算效率,使原本耗时数日的任务能够在数小时内完成。该教程将以硅晶体为例,通过 NpT 系综分子动力学,演示如何训练 vasp 机器学习力场,学习机器学习力场训练的基本流程:准备分子动力学输入文件、根据实际情况更改分子动力学和机器学习参数,并通过计算声子谱进行机器学习力场的简单验证。该教程将使用自动化脚本来使用 Phonopy...
高性能计算(HPC)在科学研究和工程中变得越来越重要,通过并行处理提高计算效率。GROMACS和LAMMPS是常用的分子动力学模拟工具,而VASP和MATLAB则专注于特定领域的建模。多种教程帮助用户掌握这些工具,提升计算效率。