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Genesis Workbench:Databricks上生命科学应用的蓝图

人工智能加速靶点发现和药物设计,结合基因组数据推动生命科学变革。基础模型提高药物研发效率,但需解决数据安全和技术复杂性问题。Genesis Workbench为生物AI/ML提供开发蓝图,简化科学家使用复杂模型的流程。

Genesis Workbench:Databricks上生命科学应用的蓝图

Databricks
Databricks · 2025-12-01T17:34:36Z
利用生成性人工智能,研究人员设计出能够杀死耐药性细菌的化合物

麻省理工学院的研究人员利用人工智能设计了新型抗生素,针对耐药性淋病奈瑟菌和耐多药金黄色葡萄球菌(MRSA)。他们生成了超过3600万个化合物,筛选出具有抗菌特性的候选药物,这些新药通过干扰细菌细胞膜的合成发挥作用,展示了AI在药物设计中的潜力。

利用生成性人工智能,研究人员设计出能够杀死耐药性细菌的化合物

MIT News - Artificial intelligence
MIT News - Artificial intelligence · 2025-08-14T15:00:00Z

蛋白质侧链构象是氨基酸残基在三维空间中的排列。斯坦福大学团队提出的FAMPNN模型能够显式建模氨基酸的序列和侧链结构,显著提升蛋白质序列设计的质量和预测准确性。该模型结合图神经网络和改进的MPNN,处理主链与侧链信息,推动蛋白质工程和药物设计的发展。

同时处理蛋白质主链和侧链信息,斯坦福等基于消息传递神经网络实现全原子结构建模

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-07-15T04:52:16Z

研究表明,氮-氧-硫(NOS)键在蛋白质中具有重要作用。德国团队利用新算法SimplifiedBondfinder识别出69个NOS键,包括精氨酸-半胱氨酸和甘氨酸-半胱氨酸的新型键。这一发现推动了蛋白质化学和药物设计的发展。

基于 8.6 万蛋白质结构数据,融合量子力学计算的机器学习方法挖掘 69 个全新氮-氧-硫键

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-06-12T07:39:51Z

乔治奥古斯特大学团队开发的计算生物学算法SimplifiedBondfinder分析了超过86,000个蛋白质结构,发现了精氨酸-半胱氨酸和甘氨酸-半胱氨酸的新型NOS键。这一发现为药物设计和生物工程提供了新的研究基础,结合了机器学习和量子力学,显著提升了研究效率和准确性。

基于8.6万蛋白质结构数据,融合量子力学计算的机器学习方法挖掘69个全新氮-氧-硫键

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-06-12T03:13:50Z

清华大学、人民大学与字节跳动团队提出了跨分子种类的生成框架UniMoMo,通过统一表示分子片段展示了其在药物设计中的潜力。该框架在多类分子任务中表现优异,验证了跨模态知识迁移的有效性。

入选ICML 2025,清华/人大/字节提出首个跨分子种类统一生成框架UniMoMo,实现多类型药物分子设计

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-05-28T05:41:31Z

本研究提出ChemDual框架,解决化学反应与逆合成预测中的数据不足问题。通过引入440万条指令,结合增强型LLaMA模型和双任务学习,显著提升了预测准确性,展现了药物设计的潜力。

使用大型语言模型和双任务学习提升化学反应和逆合成预测

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-05-05T00:00:00Z
上海交通大学医学院人工智能蛋白质设计课题组诚聘助理研究员、博士后、客座学生

张海仓是上海交通大学医学院的研究员,专注于人工智能与生命科学的交叉领域,尤其在蛋白质和药物设计方面。课题组开发了多种AI算法,并发表了多篇国际期刊论文。目前招聘助理研究员、博士后和客座学生,要求具备相关背景及Python编程能力,提供竞争力薪资和科研支持。

上海交通大学医学院人工智能蛋白质设计课题组诚聘助理研究员、博士后、客座学生

机器之心
机器之心 · 2025-03-04T05:04:00Z
一个半月内加速药物设计,浙大侯廷军团队提出深度先导化合物优化AI新方法

浙江大学研究团队提出Delete模型,结合生成人工智能与结构优化,提高药物设计效率。该模型有效优化先导化合物,生成高效结合分子。实验表明,Delete设计的抑制剂CA-B-1在抗肿瘤方面表现优异,显示出在药物发现中的潜力。

一个半月内加速药物设计,浙大侯廷军团队提出深度先导化合物优化AI新方法

机器之心
机器之心 · 2025-02-28T08:56:02Z

本研究探讨了图学习在药物设计和分子属性预测中的基准挑战,指出现有基准缺乏实际应用的关注,建议采用更具意义的基准和评估协议,以促进研究进展和领域合作。

Position Statement: Graph Learning Will Lose Relevance Due to Poor Benchmarks

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-02-20T00:00:00Z

蛋白质的功能依赖于其动态3D结构。复旦大学团队提出的4D扩散模型AlphaFolding,结合分子动力学模拟,能够高精度预测蛋白质的动态行为,推动药物设计和生命科学研究。

AlphaFolding填补蛋白质动态结构预测空白!复旦大学等提出4D扩散模型,成果入选AAAI 2025

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-02-10T10:17:56Z
迈向分子世界的视频生成模型

MIT研究团队开发的MDGen模型能够高效模拟分子动态,帮助化学家设计新药物。该模型通过学习历史数据,快速生成分子运动的模拟,显著提升了模拟的速度和准确性,为药物研发开辟了新方向。

迈向分子世界的视频生成模型

MIT News - Computer Science and Artificial Intelligence Laboratory (CSAIL)
MIT News - Computer Science and Artificial Intelligence Laboratory (CSAIL) · 2025-01-23T15:00:00Z

自2019年12月新冠疫情爆发以来,中国于2021年实施疫苗接种政策,但病毒变异使疫情形势复杂。北京大学研究团队提出的E2VD框架能够有效预测病毒变异,提高疫苗和药物设计的效率,助力应对新发病毒感染。该研究成果发表于《Nature Machine Intelligence》。

登Nature子刊!北大团队用AI预测新冠/艾滋病/流感病毒进化方向,精度提升67%

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-01-22T07:43:36Z
AI病毒进化预测新突破,北大团队进化启发通用预测框架登Nature子刊

北京大学研究团队提出了一种通用病毒进化预测模型E2VD,基于进化论视角,解决病毒变异关键问题。该模型通过定制化蛋白质语言模型和创新设计,显著提高稀有有益突变的预测精度,助力疫苗和药物设计,增强应对新发病毒的能力。

AI病毒进化预测新突破,北大团队进化启发通用预测框架登Nature子刊

机器之心
机器之心 · 2025-01-21T03:14:00Z
GPT做不好图生成?Tokenization是关键!新方法重新定义图生成和表示方式

G2PT是一种新型图生成模型,通过序列化表示提高计算效率,显著优于传统的邻接矩阵方法。该模型在药物设计和图属性预测等多个任务中表现出色,展现了广泛的适应性和优越性能,为图生成领域提供了新思路。

GPT做不好图生成?Tokenization是关键!新方法重新定义图生成和表示方式

机器之心
机器之心 · 2025-01-06T07:34:00Z
新SOTA,浙大、中科院深度学习模型可靠、准确预测蛋白-配体,助力药物开发

中国科学院与浙江大学的研究人员提出了SurfDock,一种深度学习方法,能够准确预测蛋白质-配体相互作用。该方法整合了蛋白质序列、三维结构和表面特征,优化结合姿势,性能优于现有技术。SurfDock在虚拟筛选中识别出七种新分子,具有广泛的应用潜力,推动药物设计和基础生物学研究。

新SOTA,浙大、中科院深度学习模型可靠、准确预测蛋白-配体,助力药物开发

机器之心
机器之心 · 2024-12-18T06:24:43Z
AI for Science 是科学的未来,NVIDIA 正加速它的到来

近年来,人工智能(AI)技术正在改变科学研究模式,诺贝尔奖也认可了这一趋势。尽管面临计算能力和数据规模的挑战,NVIDIA推出了多种AI工具,显著提升药物设计和气候预测等领域的科研效率。AI与科学的结合推动了跨学科创新,未来将进一步拓展科学发现的边界。

AI for Science 是科学的未来,NVIDIA 正加速它的到来

机器之心
机器之心 · 2024-12-17T03:58:06Z
NeurIPS Spotlight|从分类到生成:无训练的可控扩散生成

AIxiv专栏促进学术交流,报道超过2000篇内容。斯坦福大学等机构提出的无训练指导框架TFG,解决了扩散模型的条件生成问题,提升了生成性能。TFG在多个领域表现优异,未来有望应用于药物设计等领域。

NeurIPS Spotlight|从分类到生成:无训练的可控扩散生成

机器之心
机器之心 · 2024-12-05T03:46:52Z
准确率84.09%,腾讯AI Lab发布Interformer,用于蛋白质-配体对接及亲和力预测,登Nature子刊

腾讯 AI Lab 提出的 Interformer 模型基于 Graph-Transformer 架构,旨在改进蛋白质-配体对接和亲和力预测。该模型通过交互感知混合密度网络捕获非共价相互作用,提升了预测性能和可解释性。研究表明,Interformer 在多个基准测试中表现优异,成功识别高效小分子,展示了其在药物设计中的潜力。

准确率84.09%,腾讯AI Lab发布Interformer,用于蛋白质-配体对接及亲和力预测,登Nature子刊

机器之心
机器之心 · 2024-11-28T07:15:00Z

本研究提出了分子联合优化(MolJO)框架,解决了基于结构的分子优化在离散数据处理中的指导难题。实验结果显示,MolJO在CrossDocked2020基准测试中表现优异,成功率提高了四倍,展现了在药物设计中的应用潜力。

解锁梯度引导在基于结构的分子优化中的潜力

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2024-11-20T00:00:00Z
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